Подробная методика подготовки библиотек ДНК набором Nextera DNA Library Preparation Kit: http://www.liai.org/files/nextera_dna_sample_prep_guide_15027987_b.pdf

  1. 1. Реагенты и оборудование, необходимые для подготовки библиотек Nextera DNA

Количество расходных материалов указано из расчета на один образец.

  • Флуориметр Quantus, набор для количественного определения двухцепочечной ДНК QuantiFluor® dsDNA System и 0.5 ПЦР-пробирки (2 шт на образец).
  • Спектрофотометре Implen NanoPhotometer, безворсовые салфетки.
  • Прибор для ПЦР с нагревающейся крышкой.
  • Микроцентрифуга.
  • Вортекс.
  • Набор для подготовки библиотек Nextera DNA Sample Preparation Kit.
    • Упаковка 1 из 1:
      • TDE1 (Tagment DNA Enzyme).
      • TD (Tagment DNA Buffer).
      • NPM (Nextera PCR Master Mix).
      • PPC (PCR Primer Cocktail).
      • RSB (Resuspension Buffer).
    • Набор индексов Nextera Index Kit и сменные крышки.
    • Магнитные частицы AMPure XP Beads.

Магнитные частицы могут храниться при -2-8°С в течение 1 года.

 

Флуориметр Quantus является инструментом для измерения концентрации нуклеиновых кислот. Прибор используется с набором реагентов Promega QuantiFluor® Dye Systems.

Перед использованием прибора в первый раз, необходима калибровка прибора, также рекомендуется проводить калибровку перед началом использования каждого нового набора реагентов.

Подробная методика по использованию прибора: Quantus™ Fluorometer Operating Manual https://worldwide.promega.com/resources/protocols/technical-manuals/101/quantus-fluorometer-operating-manual-protocol/

Измерение ДНК

Необходимые материалы:

  • 0.5 ПЦР-пробирки (тонкостенные ПЦР-пробирки Axygen PCR-05-C);
  • 20Х ТЕ буфер;
  • краситель dsDNA QuantiFluor®;
  • стандарт dsDNA QuantiFluor®.

Все реагенты и образцы должны быть приведены к комнатной температуре.

Флуориметр Quantus является инструментом для измерения концентрации нуклеиновых кислот. Прибор используется с набором реагентов Promega QuantiFluor® Dye Systems.

Перед использованием прибора в первый раз, необходима калибровка прибора, также рекомендуется проводить калибровку перед началом использования каждого нового набора реагентов.

Подробная методика по использованию прибора: Quantus™ Fluorometer Operating Manual https://worldwide.promega.com/resources/protocols/technical-manuals/101/quantus-fluorometer-operating-manual-protocol/

Измерение РНК

Необходимые материалы:

  • 0.5 ПЦР-пробирки (тонкостенные ПЦР-пробирки Axygen PCR-05-C),
  • 20Х ТЕ буфер,
  • краситель RNA QuantiFluor®,
  • стандарт RNA QuantiFluor®.

Все реагенты и образцы должны быть приведены к комнатной температуре.

Прибор QIAcxel Advanced является инструментом для 12-канального капиллярного электрофореза, спроектированным для выполнения быстрого и полностью автоматизированного анализа фрагментов ДНК или качественного и количественного анализа РНК. Прибор разделяет ДНК и РНК согласно их молекулярному весу.

Подробная методика по использованию прибора для анализа ДНК: QIAxcel DNA Handbook https://www.qiagen.com/ru/resources/resourcedetail?id=f6158498-a857-4a2f-b40b-569fba3793e2&lang=en

Подробная методика по использованию прибора для анализа РНК: QIAxcel RNA Handbook https://www.qiagen.com/ru/resources/resourcedetail?id=e9f6cb28-0ae7-400d-b0de-19e734798aed&lang=en

 

Спектрофотометр Implen NanoPhotometer P-Class предназначен для определения спектра поглощения препарата в диапазоне длин волн 190-1100 нм. Подходит для анализа образцов сверхмалых (от 0.3 мкл) и стандартных объемов (в 10 мм кювете). Оснащен встроенными вортексом и принтером.

Подробная методика по использованию прибора: Implen NanoPhotometer P-Class User Manual http://www.implen.de/wp-content/uploads/2015/04/NanoPhotometer-P-Class-User-Manual-2.1.pdf