На Василеостровской площадке центра установлена система для витрификации (заморозки в слое аморфного льда) биологических образцов Leica EM HPF-100 . Эта система позволяет одномоментно остановить все биохимические процессы в образце и избежать артефактов присущих химической фиксации. Образцы после витрификации могут быть использованы для:
- замораживания-скалывания-травления с использованием системы Leica EM BAF-060 и шаттла Leica EM VCT-100 для переноса изготовленного препарата на криостолик сканирующего электронного микроскопа Tescan MIRA3 LMU
- криозамещения воды с использованием системы Leica EM ASF2 , полимеризации с использованием метакрилатной смолы Lowicryl HM23 при крио-температуре, последующей ультратомии при комнатной температуре
- методики CEMOVIS для изучения объектов в нативном гидратированном состоянии с использованием криоультратома Leica EM UC7/FC7 , томографического держателя Gatan 914 для просвечивающего электронного микроскопа Jeol JEM-2100HC ,
- сублимационной сушки с использованием системы Leica EM BAF-060 ,
- изготовления реплики с использованием системы Leica EM BAF-060 и последующей отмывки через SDS с возможностью последующего использования для метода иммуно-голд и других методик
B. Koeppe, J. Guo, P.M. Tolstoy, G. Denisov, H.-H. Limbach
«Solvent and H/D Isotope Effects on the Proton Transfer Pathways in Heteroconjugated Hydrogen-Bonded Phenol-Carboxylic Acid Anions Observed by Combined UV-Vis and NMR Spectroscopy»
J. Am. Chem. Soc. 2013, accepted.
ABSTRACT: Heteroconjugated hydrogen-bonded anions A···H···X- of phenols (AH) and carboxylic/inorganic acids (HX) dissolved in CD2Cl2 and CDF3/CDF2Cl have been studied by combined low-temperature UV-Vis and 1H/13C NMR spectroscopy (UVNMR). The systems constitute small molecular models of hydrogen-bonded cofactors in proteins such as the photoactive yellow protein (PYP). Thus, the phenols studied include the PYP cofactor 4-hydroxycinnamic acid methyl thioester, and the more acidic 4-nitrophenol and 2-chloro-4-nitrophenol which mimic electronically excited cofactor states. It is shown that the 13C chemical shifts of the phenolic residues of A···H···X-, referenced to the corresponding values of A···H···A-, constitute excellent probes for the average proton positions. These shifts correlate with those of the H-bonded protons, as well as with the H/D isotope effects on the 13C chemical shifts. A combined analysis of UV-Vis and NMR data was employed to elucidate the proton transfer pathways in a qualitative way. Dual absorption bands of the phenolic moiety indicate a double-well situation for the shortest OHO hydrogen bonds studied. Surprisingly, when the solvent polarity is low the carboxylates are protonated whereas the proton shifts towards the phenolic oxygens when the polarity is increased. This finding indicates that because of stronger ion-dipole interactions small anions are stabilized at high solvent polarities and large anions exhibiting delocalized charges at low solvent polarities. It also explains the large acidity difference of phenols and carboxylic acids in water, and the observation that this differences is strongly reduced in the interior of proteins when both partners form mutual hydrogen bonds.
В Киргизии на Бишкекском прогностическом полигоне в марте – апреле 2013 г. сотрудниками геологического факультета СПбГУ, в рамках проекта «Исследование электромагнитных полей естественных и искусственных источников в аудио- и радиочастотном диапазонах с целью развития методов мониторинга природных и техногенных процессов» шифр 3.0.114.2010, был проведен мониторинг напряжённого состояния геологической среды с использованием аппаратуры аудио и радиомагнитотеллуричекого зондирования M-K4-SM27 и M-K5-SM25F Ресурсного центра «Геомодель».
Сегодня участники конференции «The role and applications of collision processes in different kinds of plasmas and laser beams» прошли по Центру и познакомились с современным ЯМР и ЭПР спектральным оборудованием.
Присутствовали:
- Др. К. Мичулис (Рижский университет, Лазерный центр, Латвия)
- Др. Т. Кирова (Рижский университет, Лазерный центр, Латвия)
- Др. В. Кудряшев (Университет Вильнюса, Литва)
- А. С. Петровская (аспирант кафедры Оптики, физический факультет, СПбГУ; ведущий специалист РЦ «Методы анализа состава вещества»)
- Л. Г. Большакова (ст. н. сотрудник кафедры Оптики, физический факультет, СПбГУ)
Фотографии с экскурсии — в нашей галерее.