Данная вычислительная среда подготовлена для исследователей и студентов, занимающихся моделированием в области химии и материаловедения. Среда построена на базе виртуальной рабочей станции Windows 7 и имеет набор предустановленного и настроенного программного обеспечения для проведения расчетов физико-химических свойств различных веществ методами квантовой химии, молекулярной динамики и молекулярной механики, а также имеет в составе среду MATLAB для математического анализа получаемых данных.
Предустановленное программное обеспечение:
Materials Studio 7.0
Данное программное обеспечение представляет собой единую среду для решения различных задач в области материаловедения. Materials Studio обладает широким набором инструментов для моделирования молекулярных систем разного размера на различном уровне теории от квантовой химии до молекулярной механики, а также предоставляет интерфейс для хранения и анализа полученных данных.
В рамках интерфейса Materials Studio возможно проводить вычисления как в рамках виртуальной рабочей станции, так и в среде высокопроизводительных кластеров.
Gaussian 16 + GaussView 6
Gaussian – программа для моделирования молекулярных систем. Включает реализацию множества различных методов расчета физико-химических свойств молекул, таких как: DFT, MP2, CCSD, CASSCF, PM3, ONIOM и другие. Для работы с Gaussian из графического интерфейса можно использовать программу GaussView, которая позволяет подготавливать входные данные для расчета в Gaussian, запускать и отслеживать расчет и визуализировать результаты.
Кроме того, расчеты с использованием Gaussian возможно проводить из интерфейса Materials Studio в том числе и на высокопроизводительных кластерах.
Crystal 14
Crystal – программа для квантово-химическего моделирования периодических систем (кристаллов, поверхностей, полимерных цепочек), а также молекул. Поддерживает методы HF и DFT для расчетов основного состояния.
В рамках вычислительной среды на базе Windows поддерживается только 1-процессорная непараллельная версия программы и подходит для расчета лишь небольших систем. Параллельная версия программы доступна для версии под Linux.
MATLAB R2020b
MATLAB – система математического моделирования и среда программирования, ориентированная на численные методы моделирования. Традиционно более всего используется в задачах обработки сигналов, статистики и как среда разработки собственных научных приложений.
В контексте среды для химического моделирования может использоваться для анализа результатов моделирования, и написания собственных программ.
Технические характеристики вычислительной среды:
- Операционная система: Windows 7
- CPU: 4/6 ядер Intel Xeon X5670/X5675
- RAM: 8/16/32 GB
- HDD: 100 GB (по умолчанию) с возможностью расширения до 200 GB, а также временным выделением дополнительного сетевого диска
- Поддержка клиентов удаленного подключения: RDP
- Поддержка кластерных вычислений: работа с высокопроизводительными кластерами возможна через интерфейс BIOVIA Materials Studio
