Gaussian – программный пакет для расчета структуры и свойств молекулярных систем в газофазном и конденсированном состоянии, включающая большое разнообразие методов вычислительной химии, квантовой химии, молекулярного моделирования. Включает в себя реализацию множества методов для расчета структур и свойств молекул, к примеру, такие методы как: DFT, AMBER, AM1, PM3, ONIOM и т.д. Также программа позволяет генерировать так называемые cube-файлы, с которыми могут работать многие программы-визуализаторы молекулярных систем. Gaussian является одним из самых мощных, и, пожалуй, самым распространенным пакетом для решения указанных задач.
GaussView – это очень удобный и функциональных графический интерфейс для Gaussian, позволяющий обрабатывать и визуализировать результаты расчётов. Данный пакет позволяет визуализировать, например, оптимизированные молекулярные структуры, молекулярные орбитали, атомные заряды и дипольные моменты, а также многое другое.
Crystal – программный пакет для расчетов в области квантовой химии твердого тела. Разработан специально для моделирования 3- и 2-периодических кристаллических решёток и 1-периодических полимеров. Crystal позволяет вычислять энергию основного состояния, ее изменение, а также волновые функции и параметры периодических систем.
Примеры исследований, проводимых в среде
- Теоретическое моделирование сульфидных наноструктур: от слоистых кристаллов к неорганическим нанотрубкам.
- Моделирование методом теории функционала плотности фотореакций простых молекул на поверхности фотоактивированных нанокластеров диоксида титана.
- Фононы и механическая устойчивость нанотрубок на основе оксидов переходных металлов IV группы. Неэмпирические расчеты.
- Теоретический анализ атомных и электронных свойств одностенных и многостенных нанотрубок, полученных сворачиванием слоев, выделенных из слоистых кристаллов пентоксида ванадия.
- Водородная связь и переход протона в комплексах CH-кислот с sp2-гибридизованным атомом углерода.
- Квантово-химические расчеты процессов термодеструкции амидоборанов как в газовой, так и в конденсированной фазе.
Технические характеристики вычислительной среды:
- виртуальная машина c внешним IP адресом,
- доступ осуществляется по протоколу RDP ("Подключение к удаленному рабочему столу"),
- OS: Windows 7 Professional,
- CPU: 4 ядер,
- RAM: 4 GB,
- HDD: 32 GB,
- Materials Studio 7.0,
- Gaussian 09W,
- GaussView 5.0,
- Crystal 1.0.49.