Fluidigm BioMarkHD – это высокочувствительная система для проведения ПЦР в реальном времени, основанная на жидкостных микрочипах, для одновременного проведения тысяч независимых реакций в нанообъемах (~10 нл). Система состоит из оборудования, программного обеспечения и микрочипов.
Прибор может быть использован для:
- • высокопроцессивного анализа экспрессии генов,
- • генотипирования,
- • профилирования экспрессии генов на уровне единичных клеток,
- • количественной оценки числа копий молекул,
- • приготовления фрагментных библиотек при секвенировании.
Размещение: Петергофская площадка.
Статус: эксплуатация в рабочем режиме.
Основные технические характеристики
| Параметр | Характеристика |
| Чувствительность |
|
| Производительность |
|
| Фильтры возбуждения сигнала, нм |
|
| Фильтры детекции сигнала, нм |
|
| Детекция |
|
| Источник излучения |
|
| Температурный контроль |
|
| Используемые чипы |
|
| Программное обеспечение |
|
В составе прибора имеются станции для работы с чипами Dynamic Arrays 48.48, 192.24, Access Array 48.48 и Digital Array 48.770.
Подробнее: ссылка на сайт производителя – www.fluidigm.com.
Принцип работы
В основе системы лежит жидкостной микрочип, состоящий из тысяч нанокамер и системы капилляров с управляемыми затворами. Нанокамеры расположены попарно, так что в каждой паре одна камера предназначена для реакционной смеси и одна для образца. Микрочип соединён каналами с лунками для нанесения реакционных смесей и образцов. Пользователь заполняет лунки для нанесения, после чего система распределяет реакционные смеси и образцы по нанокамерам. Далее происходит попарное смешивание образцов и реакционных смесей в камерах для реакционных смесей, после чего происходит термоциклирование и фиксация флуоресценции CCD-камерой. Система позволяет проводить до 9 216 независимых реакций за один раз. При приготовлении фрагментных библиотек используются специальные микрочипы (Access Array), позволяющие производить выгрузку продуктов ПЦР реакции с использованием имеющийся в наличии станции. При проведении цифровая ПЦР (Digital PCR) ограниченное количество образцов (12) распределяется по большому количеству нанокамер, так что в каждую камеру попадает не более одной копии целевой ДНК. Количество нанокамер, в которых прошла реакция амплификации, отражает абсолютное количество искомых молекул в исходном образце.
