В рамках работы эколого-математического комплекса может быть применено следующее специализированное программное обеспечение.

AnyLogic – программный пакет для многопрофильного имитационного моделирования сложных систем и процессов. Поддерживает основные направления ситуационного моделирования:

• - дискретно-событийное моделирование;
• - системная динамика;
• - агентное моделирование.

Более того, AnyLogic позволяет объединять все вышеперечисленные подходы воедино в рамках одной модели. Широкие возможности продукта делают его эффективным средством моделирования экосистем, распространения аэрозолей и газов в атмосфере, динамики лесных пожаров.

AnyLogic обладает развитыми средствами визуализации процесса и результатов моделирования как на плоскости, так и в виде трехмерных моделей объектов, что значительно упрощает восприятие моделей и их корректную интерпретацию.
Интеграция компилятора Java позволяет расширять функционал программного продукта посредством создания и подключения дополнительных библиотек. Модели могут быть представлены в виде Java-апплетов, что упрощает доступ – весь процесс моделирования будет доступен любому пользователю через браузер. 

TreeAge Pro – программный продукт для принятия решений в условии неопределенности на основе деревьев принятия решений, диаграмм влияния либо марковских моделей. Позволяет работать со сложными аналитическими моделями: структурировать их, выделять возможные варианты поведения, производить поиск оптимальных решений как с позиции максимизации прибыли, так и с точки зрения минимизации рисков, производить анализ чувствительности, имитационное моделирование, оценивать риски и эффективность рассматриваемых решений. Данные возможности позволяют использовать программное обеспечение для оценки экологического ущерба либо рисков его возникновения, поиска оптимальных мер по предотвращению / нейтрализации ущерба.

Для автоматизации импорта и экспорта данных возможна интеграция TreeAge Pro с электронными таблицами либо базами данных. Построенные модели принятия решений можно реализовать в виде автономных программных средств, доступ к которым можно получить как локально, так и через сеть.

COMSOL Multiphysics – средство для моделирования разнообразных физических процессов, описываемых дифференциальными уравнениями в частных производных, посредством метода конечных элементов. Позволяет работать с мультифизическими задачами, описываемыми комбинациями уравнений, благодаря чему может быть произведен комплексный анализ модели. Возможна работа с объектами произвольных геометрических структур, которые могут быть построены как в самой программе, так и импортированы из сторонних САПР.

COMSOL Multiphysics поддерживает работу с такими физическими областями, как моделирование потоков тепла, переноса вещества, электрических токов, плазмы и др. При работе могут автоматически учитываться свойства материалов рассматриваемых объектов. Столь  широкие возможности могут быть применены в комплексном анализе процессов, способных оказать влияние на экологию.
Программа поддерживает параметризованный вывод результатов моделирования в виде плоских или трехмерных объектов. Для интеграции со сторонними средствами и автоматизации моделирования может быть применен пакет MATLAB.

Ресурсный центр обладает возможностью проведения экспериментов по NPD как на базе ПИЯФ НИЦ КИ:

Секционный суперпозиционный порошковый дифрактометр SSPD, канал №9,

48-счётчиковый порошковый дифрактометр PD, канал №1,

так и организацией (подготовка заявок) и проведением экспериментов по NPD на базе современных европейских нейтронных центров:

Лаборатория нейтронной физики им. И.М. Франка, ОИЯИ (реактор ИБР-2, Дубна, Россия):

1. ФДВР Фурье-дифрактометр  высокого разрешения.

2. ДН-2 Многофункциональный нейтронный спектрометр.

3.Спектрометр ДН-6 для исследования микрообразцов.

4. ФСД Фурье-стресс-дифрактометр.

5. Дифрактометр для исследования микрообразцов ДН-12.

6. Стресс-дифрактометр ЭПСИЛОН-МДС и дифрактометр для количественного анализа текстуры СКАТ.

Heinz Maier-Leibnitz Zentrum (реактор TUM-II, Мюнхен, Германия):

1. SPODI High resolution powder diffractometer.

2. STRESS-SPEC Materials science diffractometer.

Leon Brillouin Laboratory (LLB) in the CEA-Saclay Centre (реактор Orphee, Сакле, Франция)

1. 3T2 –"Thermal neutrons" 2-axis (20 detectors) high resolution, mainly for nuclear structure determination.

2. G4.1 –"Cold neutrons" 2-axis (multidetector 800 cells) high flux, mainly for magnetic structure determination.

3. G6.1 –"Cold neutrons" 2-axis (high flux).

4. PHR- G44"Cold neutrons" 2-axis (7x10 detectors) high resolution, for structure determination on polycrystalline samples with large unit cell.

http://www-llb.cea.fr/en/fr-en/pdf/powder-diff-llb.pdf

Institut Laue-Langevin (ILL) (Гренобль, Франция)

1. D2B – High-resolution two-axis diffractometer.

2. D20 – High-intensity two-axis diffractometer with variable resolution.

3. D1B – High resolution neutron two-axis powder diffractometer.

4. D4 – Liquids and Amorphous Diffractometer.

5. SALSA – Strain analyser for engineering applications.

Часто применение нейтронной порошковой дифракции особенно эффективно при параллельном исследовании тех же образцов методом синхротронной порошковой дифракции, что сегодня осуществимо после вступления России ассоциируемым членом крупнейшего в мире синхротрона ESRF. Там для дифракции доступны несколько станций:

1. ID01 – Microdiffraction imaging.

2. ID03 – Surface diffraction.

3. ID11 – Materials science, time-resolved diffraction.

4. ID15A/B – High-energy diffraction/scattering.

5. ID22 – Powder diffraction.

http://www.esrf.eu/UsersAndScience/Experiments/StructMaterials

А также:

1. BM1 – SNBL (Swiss-Norwegian Beamlines) X-ray absorption and diffraction.

2. BM2 – D2AM (French CRG Beamline) Materials science.

3. BM8 – GILDA (General Purpose Italian Beamline for X-ray Diffraction and Absorption).

4. BM25 – SpLine (Spanish CRG beamline) X-ray absorption and diffraction.

http://www.esrf.eu/UsersAndScience/Experiments/CRG

Ресурсный центр обладает возможностью проведения экспериментов как на базе ПИЯФ НИЦ КИ:

• 48-счетчиковый порошковый дифрактометр DP, канал №1, 

так и организации (подготовки заявок) и проведения дифракционных экспериментов на базе современных европейских научных нейтронных центров, таких как ОИЯИ (Дубна, Россия), ILL (Гренобль, Франция), PSI (Виллинген, Швейцария), HZB (Берлин, Германия) и т.д.

Ресурсный центр обладает возможностью проведения экспериментов по нейтронной дифракции как на базе ПИЯФ НИЦ КИ:

Дифрактометр поляризованных нейтронов, канал №6

так и организации (подготовки заявок) и проведения экспериментов по дифракционным экспериментам на базе современных европейских нейтронных центров:

• Heinz Maier-Leibnitz Zentrum (реактор TUM-II, Мюнхен, Германия): монокристальные дифрактометры HEiDi, RESI, дифрактометр поляризованных нейтронов на горячем источнике POLI, трехосный спектрометр холодных нейтронов PANDA;
• Institute Laue-Langevin (реактор HFR, Гренобль, Франция): дифрактометр D23, трехосный спектрометр тепловых нейтронов IN22;
• Laboratoire Léon Brillouin (реактор Orphee, Сакле, Франция).

Ресурсный центр обладает как возможностью проведения экспериментов по МУРН на базе ПИЯФ НИЦ КИ:

• малоугловой дифрактометр "Мембрана", канал №5,
• малоугловой дифрактометр поляризованных нейтронов "Вектор", канал №4,

так и организацией (подготовка заявок) и проведением экспериментов по МУРН и УМУРН на базе современных европейских нейтронных центров:

• Лаборатория нейтронной физики им. И.М. Франка, ОИЯИ (реактор ИБР-2, Дубна, Россия), спектрометр малоуглового рассеяния нейтронов ЮМО;
• Heinz Maier-Leibnitz Zentrum (реактор TUM-II, Мюнхен, Германия): малоугловые дифрактометры KWS-1, KWS-2 и SANS-1; малоугловой дифрактометр высокого разрешения KWS-3, работающий с использованием фокусирующего тороидального зеркала, что позволяет достигать высокого разрешения по переданным импульсам вплоть до 1×10^-4 Ǻ^-1;
• Budapest Neutron Centre (Будапешт, Венгрия), малоугловой дифрактометр "Yellow submarine";
• Neutron Physics Laboratory (реактор LVR-15, Прага, Чехия), двух-кристальный дифрактометр высокого разрешения MAUD.