Прибор предназначен для проведения высокопроизводительного секвенирования нуклеиновых кислот (NGS секвенирования).
Производитель: Illumina, США.
Cайт: http://www.illumina.com/systems/miseq.html
1. Основные характеристики
Illumina MiSeq Sequencing System мощная и эффективная высокопроизводительная система для секвенирования. Использование данного прибора позволяет быстро получить результаты высокого качества с большой длинной прочтения ДНК. Идеально подходит для секвенирования маленьких геномов, а так же целевого секвенирования генов.
Система HiSeq 4000 использует секвенирование методом синтеза (SBS), самую успешную и широко используемую технологию секвенирования нового поколения. Технология SBS поддерживает массово-параллельное секвенирование, используя метод флуоресцентно-меченных нуклеотидов, который позволяет прочтение отдельных оснований, по мере их включения в растущие нити ДНК.
Длина читаемого фрагмента |
Общее время, необходимое для амплификации кластеров и секвенирования |
Производительность |
2 х 25 п.н. |
~4,5 часа |
250 – 350 Mb
|
2 х 100 п.н. |
~19 часов |
1,0– 1,4 Gb |
2 х 150 п.н. |
~27 часов |
1,5– 2,0 Gb |
2 х 250 п.н. |
~36 часов |
6,0– 8,0 Gb |
Количество кластеров |
5,0– 7,0 миллионов высококлассных отфильтрованных кластеров при длине читаемого фрагмента 2 х 150 п.н. До 15.0 миллионов высококлассных отфильтрованных кластеров при длине читаемого фрагмента 2 х 250 п.н. |
|
Качество неотфильтрованных данных |
>90% оснований качества Q30 при 2 х 25 п.н. >85% оснований качества Q30 при 2 х 100 п.н. >80% оснований качества Q30 при 2 х 150 п.н. >75% оснований качества Q30 при 2 х 250 п.н. |
Секвенирование нового поколения может использоваться для следующих задач:
- • Секвенирование малых геномов и ампликонов.
- • Целевое секвенирование генов.
2. Дополнительное оборудование
- • cBot System для автоматического генерирования кластеров.
- • Флуориметр Quantus для измерения концентрации библиотек.
- • Система капиллярного гель – электрофореза QIAxcel для проверки распределения размера фрагментов библиотек.