Прибор предназначен для проведения высокопроизводительного секвенирования нуклеиновых кислот (NGS секвенирования).


  

Производитель: Illumina, США.

Cайт:  http://www.illumina.com/systems/miseq.html 

1. Основные характеристики

Illumina MiSeq Sequencing System мощная и эффективная высокопроизводительная система для секвенирования. Использование данного прибора позволяет быстро получить результаты высокого качества с большой длинной прочтения ДНК. Идеально подходит для секвенирования маленьких геномов, а так же целевого секвенирования генов.

Система HiSeq 4000 использует секвенирование методом синтеза (SBS), самую успешную и широко используемую технологию секвенирования нового поколения. Технология SBS поддерживает массово-параллельное секвенирование, используя метод флуоресцентно-меченных нуклеотидов, который позволяет прочтение отдельных оснований, по мере их включения в растущие нити ДНК.

Длина читаемого фрагмента

Общее время, необходимое для амплификации кластеров и секвенирования

Производительность

2 х 25 п.н.

~4,5 часа

250 – 350 Mb

 

2 х 100 п.н.

~19 часов

1,0– 1,4 Gb

2 х 150 п.н.

~27 часов

1,5– 2,0 Gb

2 х 250 п.н.

~36 часов

6,0– 8,0 Gb

Количество кластеров

5,0– 7,0 миллионов высококлассных отфильтрованных кластеров при длине читаемого фрагмента 2 х 150 п.н.

До 15.0 миллионов высококлассных отфильтрованных кластеров при длине  читаемого фрагмента 2 х 250 п.н.

Качество неотфильтрованных данных

>90% оснований качества Q30 при 2 х 25 п.н.

>85% оснований качества Q30 при 2 х 100 п.н.

>80% оснований качества Q30 при 2 х 150 п.н.

>75% оснований качества Q30 при 2 х 250 п.н.

Секвенирование нового поколения может использоваться для следующих задач:

  • • Секвенирование малых геномов и ампликонов.
  • • Целевое секвенирование генов.

2. Дополнительное оборудование

  • • cBot System для автоматического генерирования кластеров.
  • • Флуориметр Quantus для измерения концентрации библиотек.
  • • Система капиллярного гель – электрофореза QIAxcel для проверки распределения размера фрагментов библиотек.