Прибор предназначен для проведения высокопроизводительного секвенирования нуклеиновых кислот (NGS секвенирования).


  

Производитель: Illumina, США.

Cайт: http://www.illumina.com/systems/hiseq-3000-4000.html

Статус: введено в эксплуатацию.

 1. Основные характеристики

Illumina HiSeq 4000 мощная и эффективная высокопроизводительная система для секвенирования, которая поддерживает широчайшее разнообразие прикладных задач и исследования любых объемов.

Система HiSeq 4000 использует секвенирование методом синтеза (SBS), самую успешную и широко используемую технологию секвенирования нового поколения. Технология SBS поддерживает массово-параллельное секвенирование, используя метод флуоресцентно-меченных нуклеотидов, который позволяет прочтение отдельных оснований, по мере их включения в растущие нити ДНК.

Секвенирование нового поколения может использоваться для следующих задач:

  • • Полногеномное секвенирование («de novo» секвенирование);
  • • Ресеквенирование геномов или его отдельных участков для выявления полиморфизмов и мутаций;
  • • Секвенирование экзомов;
  • • Секвенирование транскриптомов для анализа профиля экспрессии клеток;
  • • Анализ метагенома;
  • • Изучение взаимодействия ДНК с протеинами и экспрессией генов, используя Chip-Seq;
  • • Анализ эпигенетических модификаций ДНК, например профиля метилирования.

Общая производительность:

Версия прибора

HiSeq 4000

Количество ячеек

2

Количество чтений, млн (1 ячейка)

2100-2500

Максимальная длина чтения

2x150

Максимальная производительность, Gb

30-750

2. Дополнительное оборудование

  • • cBot System для автоматического генерирования кластеров.
  • • Флуориметр Quantus для измерения концентрации библиотек.
  • • Система капиллярного гель – электрофореза QIAxcel для проверки распределения размера фрагментов библиотек.

3. Расходные материалы

Перечень наборов для генерации кластеров:

GD-310-1001

HiSeq3000/4000 cBotMulti-Primer

SY-401-2015

Коллектор HiSeq cBot

Перечень наборов для секвенирования:

FC-410-1003

Комплект SBS HiSeq 3000/4000 (300 циклов)

FC-410-1002

Комплект SBS HiSeq 3000/4000  (150 циклов)

FC-410-1001

Комплект SBS HiSeq 3000/4000 (50 циклов)