Прибор предназначен для проведения высокопроизводительного секвенирования нуклеиновых кислот (NGS секвенирования).
Производитель: Illumina, США.
Cайт: http://www.illumina.com/systems/hiseq-3000-4000.html
1. Основные характеристики
Illumina HiSeq 4000 мощная и эффективная высокопроизводительная система для секвенирования, которая поддерживает широчайшее разнообразие прикладных задач и исследования любых объемов.
Система HiSeq 4000 использует секвенирование методом синтеза (SBS), самую успешную и широко используемую технологию секвенирования нового поколения. Технология SBS поддерживает массово-параллельное секвенирование, используя метод флуоресцентно-меченных нуклеотидов, который позволяет прочтение отдельных оснований, по мере их включения в растущие нити ДНК.
Секвенирование нового поколения может использоваться для следующих задач:
- • Полногеномное секвенирование («de novo» секвенирование);
- • Ресеквенирование геномов или его отдельных участков для выявления полиморфизмов и мутаций;
- • Секвенирование экзомов;
- • Секвенирование транскриптомов для анализа профиля экспрессии клеток;
- • Анализ метагенома;
- • Изучение взаимодействия ДНК с протеинами и экспрессией генов, используя Chip-Seq;
- • Анализ эпигенетических модификаций ДНК, например профиля метилирования.
Общая производительность:
Версия прибора |
HiSeq 4000 |
Количество ячеек |
2 |
Количество чтений, млн (1 ячейка) |
2100-2500 |
Максимальная длина чтения |
2x150 |
Максимальная производительность, Gb |
30-750 |
2. Дополнительное оборудование
- • cBot System для автоматического генерирования кластеров.
- • Флуориметр Quantus для измерения концентрации библиотек.
- • Система капиллярного гель – электрофореза QIAxcel для проверки распределения размера фрагментов библиотек.
3. Расходные материалы
Перечень наборов для генерации кластеров:
GD-310-1001 |
HiSeq3000/4000 cBotMulti-Primer |
SY-401-2015 |
Коллектор HiSeq cBot |
Перечень наборов для секвенирования:
FC-410-1003 |
Комплект SBS HiSeq 3000/4000 (300 циклов) |
FC-410-1002 |
Комплект SBS HiSeq 3000/4000 (150 циклов) |
FC-410-1001 |
Комплект SBS HiSeq 3000/4000 (50 циклов) |