На Петергофской площадке центра установлена хроматографическая полупрепаративная система FPLC BioRad NGC Discovery . На данный момент возможна работа только при наличии у пользователей собственных колонок. В дальнейшем планируется закупка набора наиболее востребованных колонок и холодильного шкафа для системы и коллектора фракций, что позволит работать с температурно-чувствительными белками.