Fluidigm BioMarkHD – это высокочувствительная система для проведения ПЦР в реальном времени, основанная на жидкостных микрочипах, для одновременного проведения тысяч независимых реакций в нанообъемах (~10 нл). Система состоит из оборудования, программного обеспечения и микрочипов.

прибор может быть использован для:

      • высокопроцессивного анализа экспрессии генов

      • генотипирования 

      • профилирования экспрессии генов на уровне единичных клеток

      • количественной оценки числа копий молекул

      • приготовления фрагментных библиотек при секвенировании

Размещение: петергофская площадка

Статус: эксплуатация в рабочем режиме

 

fluidigm-biomark.jpg

Основные технические характеристики

Параметр Характеристика
Чувствительность детекция вплоть до 1 молекулы
Производительность от 2 304 до 36 960 индивидуальных ПЦР реакций за запуск прибора (2-3 часа), более 50 000 точек данных в день
Фильтры возбуждения сигнала, нм 475, 530, 575
Фильтры детекции сигнала, нм 525, 570, 630
Детекция CCD камера
Источник излучения LED
Температурный контроль
элементы Пельтье, диапазон 44°С-99°С
нагрев: >5°C/сек
охлаждение: >5°C/сек
Используемые чипы
48.48, 96.96 и 192.24 Dynamic Arrays
многоразовые FR48.48 и FR192.24 Dynamic Array 12.765
и 48. 770 Digital Arrays
Программное обеспечение
BioMark™ Data Collection Software
BioMark™ Real-Time PCR Analysis software
BioMark™ Genotyping Analysis software
BioMark™ Digital PCR Analysis software

В составе прибора имеются станции для работы с чипами Dynamic Arrays 48.48, 192.24,  Access Array 48.48 и Digital Array 48.770

Подробнее: ссылка на сайт производителя: www.fluidigm.com

Принцип работы

В основе системы лежит жидкостной микрочип, состоящий из тысяч нанокамер и системы капилляров с управляемыми затворами. Нанокамеры расположены попарно, так что в каждой паре одна камера предназначена для реакционной смеси и одна для образца. Микрочип соединён каналами с лунками для нанесения реакционных смесей и образцов. Пользователь заполняет лунки для нанесения, после чего система распределяет реакционные смеси и образцы по нанокамерам. Далее происходит попарное смешивание образцов и реакционных смесей в камерах для реакционных смесей, после чего происходит термоциклирование и фиксация флуоресценции CCD-камерой. Система позволяет проводить до 9216 независимых реакций за один раз. При приготовлении фрагментных библиотек используются специальные микрочипы (Access Array), позволяющие производить выгрузку продуктов ПЦР реакции с использованием имеющийся в наличии станции. При проведении цифровая ПЦР (Digital PCR) ограниченное количество образцов (12) распределяется по большому количеству нанокамер, так что в каждую камеру попадает не более одной копии целевой ДНК. Количество нанокамер, в которых прошла реакция амплификации, отражает абсолютное количество искомых молекул в исходном образце.