Пиросеквенатор Roche Junior GS 

прибор может быть использован для:

      • De novo секвенирование микробных и вирусных геномов.

      • Целевое ресеквенирование интересующих областей генома.

      • Сверхглубокое секвенирование ампликонов с целью поиска редких мутаций.

      • Исследование метагеномов смешанных образцов из окружающей среды.

      • Секвенирование транскриптома.

Размещение: петергофская площадка

Статус: эксплуатация в рабочем режиме

 

roche-gs-junior.jpg

Основные технические характеристики

Производительность Более 35 миллионов нуклеотидов за один запуск
Время запуска 10 часов – секвенирование 2 часа – первичная обработка данных
Длина прочтений Средняя длина – 400 нуклеотидов
Точность 99% для 400 нуклеотидов
Количество прочтений за один запуск 100 000 прочтений

Принцип работы

Секвенирование с помощью прибора GS Junior включает в себя 4 этапа: 

  1. Приготовление библиотеки.
  2. Эмульсионная ПЦР.
  3. Пиросеквенирование.
  4. Анализ результатов.

Требования к образцам

В качестве образца для секвенирования может выступать геномная ДНК, ампликоны, кДНК, BAC. Из образца ДНК должна быть приготовлена библиотека, в которой секвенируемые фрагменты ДНК фланкированы участками для связывания универсальных праймеров для пиросеквенирования.