Пиросеквенатор Roche Junior GS. 

Прибор может быть использован для:

  • • De novo секвенирование микробных и вирусных геномов;
  • • целевое ресеквенирование интересующих областей генома;
  • • сверхглубокое секвенирование ампликонов с целью поиска редких мутаций;
  • • исследование метагеномов смешанных образцов из окружающей среды;
  • • секвенирование транскриптома.

Размещение: Петергофская площадка.

Статус: эксплуатация в рабочем режиме.

 

roche-gs-junior.jpg

 

Основные технические характеристики

Производительность более 35 миллионов нуклеотидов за один запуск
Время запуска 10 ч. – секвенирование 2 ч. – первичная обработка данных
Длина прочтений средняя длина – 400 нуклеотидов
Точность 99% для 400 нуклеотидов
Количество прочтений за один запуск 100 000 прочтений

Принцип работы

Секвенирование с помощью прибора GS Junior включает в себя 4 этапа.

  1. Приготовление библиотеки.
  2. Эмульсионная ПЦР.
  3. Пиросеквенирование.
  4. Анализ результатов.

Требования к образцам

В качестве образца для секвенирования может выступать геномная ДНК, ампликоны, кДНК, BAC. Из образца ДНК должна быть приготовлена библиотека, в которой секвенируемые фрагменты ДНК фланкированы участками для связывания универсальных праймеров для пиросеквенирования.