Пиросеквенатор Roche Junior GS. 

Прибор может быть использован для:

  • • De novo секвенирование микробных и вирусных геномов;
  • • целевое ресеквенирование интересующих областей генома;
  • • сверхглубокое секвенирование ампликонов с целью поиска редких мутаций;
  • • исследование метагеномов смешанных образцов из окружающей среды;
  • • секвенирование транскриптома.

Размещение: Петергофская площадка.

Статус: эксплуатация в рабочем режиме.

Вниманию пользователей РЦ РМиКТ предлагается один из лидеров рынка секвенаторов следующего поколения, прибор Ion Torrent PGM (Life Technologies), основанный на системе полупроводникового секвенирования. К его основным преимуществам относят высокую скорость чтения (80-100 Mb/ч) и наименьшую продолжительность одного запуска (~3 ч.), по сравнению с приборами 454 GS Junior (Roche) и MiSeq (Illumina), а также низкую стоимость чтения. К недостаткам следует отнести сравнительно высокий уровень ошибок для одиночных нефильтрованных прочтений. Для прибора существуют чипы различной производительности, позволяющие варьировать глубиной прочтения от 10 Мб до 1 000 Mb, в зависимости от задач исследования (Loman, N. J. et al. Nature Biotechnol.  2012). 

Генетический анализатор ABI Prism 310 представляет собой автоматический однокапиллярный секвенатор, который может быть использован для различных приложений, требующих определения нуклеотидной последовательности и анализа размера и относительного количества фрагментов ДНК. Может применяться для сравнительного секвенирования, для обнаружения и подтверждения наличия мутаций и SNP, STR-, AFLP- и SSCP-анализов.

Размещение: Петергофская площадка.

Статус: эксплуатация в рабочем режиме.

abi-prism-310.jpg

Генетический анализатор ABI Prism 3500xl представляет собой автоматический 24-капиллярный секвенатор, который может быть использован для различных приложений, требующих определения нуклеотидной последовательности и анализа размера и относительного количества фрагментов ДНК. Может применяться для сравнительного секвенирования, для обнаружения и подтверждения наличия мутаций и SNP, STR-, AFLP- и SSCP-анализов.

Размещение: Петергофская площадка.

Статус: эксплуатация в рабочем режиме.

abi-prism-3500xl.jpg

Fluidigm BioMarkHD – это высокочувствительная система для проведения ПЦР в реальном времени, основанная на жидкостных микрочипах, для одновременного проведения тысяч независимых реакций в нанообъемах (~10 нл). Система состоит из оборудования, программного обеспечения и микрочипов.

Прибор может быть использован для:

  • • высокопроцессивного анализа экспрессии генов,
  • • генотипирования,
  • • профилирования экспрессии генов на уровне единичных клеток,
  • • количественной оценки числа копий молекул,
  • • приготовления фрагментных библиотек при секвенировании.

Размещение: Петергофская площадка.

Статус: эксплуатация в рабочем режиме.