ДОПОЛНИТЕЛЬНАЯ ОБРАЗОВАТЕЛЬНАЯ ПРОГРАММА

повышения квалификации

«Современные методы протеомики и белковой химии. Практический курс»

(рег. номер учебного плана 16/0888/1) 

Длительность курса: 72 академических часа, из них 56 часов контактной работы.

Длительность обучения: 5 рабочих дней (с отрывом от работы).

Стоимость обучения на 2016/2017 учебный год: 20500 руб.

Языки обучения: русский. 

Руководитель: к.б.н. Мальцева Арина Леонидовна, старший преподаватель, Кафедра зоологии беспозвоночных СПбГУ. E-mail: Этот адрес электронной почты защищен от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.; телефон: (812) 3289688, (812) 3289696. 

Целью курса является теоретическое и практическое ознакомление слушателей с разнообразием методов современных протеомики и белковой химии. Задачи курса: (1) углубить представление о методической базе современных протеомики химии и белка; (2) расширить представление о круге фундаментальных и прикладных задач, решаемых с привлечением протеомных методов; (3) сформировать навыки планирования протеомных и биохимических исследований; (4) создать у слушателей практические навыки по проведению протеомных экспериментов и умение интерпретировать получаемые результаты. 

Результаты обучения (получаемые компетенции):

ДК-1: Способен к самостоятельному освоению новых методов исследования, к изменению профиля своей профессиональной деятельности;

ДК-2: Готов самостоятельно приобретать с помощью информационных технологий и использовать в практической деятельности новые знания и умения, в том числе в новых областях, способен формировать ресурсно-информационные базы для решения профессиональных задач;

ДК-3: Демонстрирует высокий уровень профессиональной методической подготовки, полученной в процессе выполнения самостоятельной научно-исследовательской работы;

ДК-4: Способен к самостоятельному планированию и организации проведения научно-исследовательских и производственно-технологических работ в рамках поставленных задач;

ДК-5: Знание возможностей и ограничений методов современных протеомики и белковой химии и возможностей их применения для решения задач биологии и химии;

ДК-6: Умение самостоятельно применять методы современных протеомики и белковой химии для решения задач научно-исследовательской работы и грамотно интерпретировать результаты;

ДК-7: Знание оборудование и программного обеспечения, необходимого для проведения протеомных исследований. 

ПРОГРАММА КУРСА 

№ п/п

Наименование темы (раздела, части)

Вид учебных занятий

Количество часов

1

Введение.

Обзор курса. Дисциплинарные рекомендации.

Химия белка и протеомика - сравнительный обзор возможностей, задач и методов.

Лекции

2

2

Обзор методов работы с белками и пептидами.

Экстракты и лизаты. Подходы к фракционированию сложных смесей. Электрофорез. Хроматография.

Методы визуализации и идентификации и идентификации белков/пептидов. Флуориметрия. Масс-спектрометрия.

Лекции

4

Самостоятельная работа по методическим материалам

1

3

Подготовительный этап практических занятий.

Подготовка образцов для 1D- и 2D-электрофорезов. Подготовка гелей. Приготовление буферов.

Семинар

1

Практические занятия

6

Самостоятельная работа по методическим материалам

1

4

2D-DIGEэлектрофорез

Коньюгирование образцов с флуорофорами Су, регидратация и загрузка пробы на IPG-стрипы, изоэлектрическое фокусирование, электрофорез второго направления по Лэммли, визуализация DIGE-гелей с использование лазерного сканера, окрашивание гелей бриллиантовым голубым.

Семинар

2

Практические занятия

12

Самостоятельная работа по методическим материалам

2

5

Bottom-upподход для идентификации белков.

Вырезание дифференциальных пятен из гелей, трипсинолиз белков в геле, экстракция триптических пептидов, LC-MS/MS анализ полученных экстрактов

Семинар

1

Практические занятия

12

Самостоятельная работа по методическим материалам

2

6

Иммуноблот.

Проведение электрофореза в трис-трициновой буферной системе, перенос белков на PVDF-мембрану, подготовка мембраны, окрашивание антителами, визуализация иммуноблота.

Семинар

1

Практические занятия

12

Самостоятельная работа по методическим материалам

2

7

Подведение итогов. Обсуждение подготовки отчетов по проделанной практической работе.

Семинар

1

8

Подготовка слушателями отчетов по проделанной работе.

Самостоятельная работа

8

9

Итоговая аттестация. Итоговый зачет.

Итоговая аттестация

2